computeMMFFCharges(const ROMol &mol) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFAngleBendParams(const ROMol &mol, const unsigned int idx1, const unsigned int idx2, const unsigned int idx3, unsigned int &angleType, MMFFAngle &mmffAngleBendParams) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFAngleTerm() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFAngleType(const ROMol &mol, const unsigned int idx1, const unsigned int idx2, const unsigned int idx3) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFAtomType(const unsigned int idx) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFBondStretchEmpiricalRuleParams(const ROMol &mol, const Bond *bond) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFBondStretchParams(const ROMol &mol, const unsigned int idx1, const unsigned int idx2, unsigned int &bondType, MMFFBond &mmffBondStretchParams) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFBondTerm() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFBondType(const Bond *bond) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFDielectricConstant() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFDielectricModel() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFEleTerm() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFFormalCharge(const unsigned int idx) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFOopBendParams(const ROMol &mol, const unsigned int idx1, const unsigned int idx2, const unsigned int idx3, const unsigned int idx4, MMFFOop &mmffOopBendParams) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFOopTerm() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFOStream() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFPartialCharge(const unsigned int idx) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFStretchBendParams(const ROMol &mol, const unsigned int idx1, const unsigned int idx2, const unsigned int idx3, unsigned int &stretchBendType, MMFFStbn &mmffStretchBendParams, MMFFBond mmffBondStretchParams[2], MMFFAngle &mmffAngleBendParams) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFStretchBendTerm() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFTorsionEmpiricalRuleParams(const ROMol &mol, unsigned int idx2, unsigned int idx3) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFTorsionParams(const ROMol &mol, const unsigned int idx1, const unsigned int idx2, const unsigned int idx3, const unsigned int idx4, unsigned int &torsionType, MMFFTor &mmffTorsionParams) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFTorsionTerm() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFTorsionType(const ROMol &mol, const unsigned int idx1, const unsigned int idx2, const unsigned int idx3, const unsigned int idx4) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFVariant() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFVdWParams(const unsigned int idx1, const unsigned int idx2, MMFFVdWRijstarEps &mmffVdWParams) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
getMMFFVdWTerm() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
getMMFFVerbosity() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
isValid() | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
MMFFMolProperties(ROMol &mol, const std::string &mmffVariant="MMFF94", std::uint8_t verbosity=MMFF_VERBOSITY_NONE, std::ostream &oStream=std::cout) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |
setMMFFAngleTerm(const bool state) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFBondTerm(const bool state) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFDielectricConstant(const double dielConst) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFDielectricModel(std::uint8_t dielModel) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFEleTerm(const bool state) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFOopTerm(const bool state) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFOStream(std::ostream *oStream) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFStretchBendTerm(const bool state) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFTorsionTerm(const bool state) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFVariant(const std::string &mmffVariant) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFVdWTerm(const bool state) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
setMMFFVerbosity(std::uint8_t verbosity) | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | inline |
~MMFFMolProperties()=default | RDKit::MMFF::MMFFMolProperties | |